军工企业股权架构方案设计是一个重要的管理工作，它为企业提供了有效的治理结构，以实现公司的长远发展目标。以下是一份详细的股权架构方案设计的内容：

1. 股东结构设计：

- 设定合理的股权比例，以确保主要股东能够维持持续的控制力。通常，国家或政府机构应是主要股东，占据大部分股权。少量股权可以分配给其他合资企业、民营企业和个人投资者。

- 设立独立董事会，其中包括具有相关经验的行业专家、高级军事官员和财经专家。独立董事的任命应符合法定要求，并确保其独立性和专业性。

2. 股东权益保护：

- 制定明确的协议和合同，明确各股东的权益和责任，包括投票权、红利分配和资产转让。这样可以防止不希望的股权变动和持股权益的损害。

- 设立股东协议控制机制，以确保关键决策需要得到主要股东的同意。设定有关股权转让的限制和审批程序，以防止非法转让和不当控制。

3. 股权激励计划：

- 设计并实施股权激励计划，以吸引和留住优秀的管理人才。这包括向高级管理层和关键员工分配股权，使他们与企业的利益保持一致。这将激励员工积极工作，并为公司的长期发展提供支持。

- 制定合理的股权激励政策和计划，包括适当的权责结构、激励时间表和回报机制。同时，定期评估和更新激励计划，以确保其持久有效。

4. 股东会议和审计机制：

- 每年召开定期股东大会，报告公司的经营状况、财务状况和发展计划，并听取股东的意见和建议。确保全体股东的参与和监督权。

- 建立独立审计委员会，由经验丰富的审计专业人员组成，承担对公司财务报告的审核和监督职责。保证财务信息的真实性和可靠性，确保合规和职业道德。

股权架构方案设计是一个复杂的任务，需要考虑到各方面的利益和风险，并确保企业的稳定运作和可持续发展。以上讨论的内容是基本原则和指导，具体的方案应根据军工企业的实际情况进行调整和细化。